Для записи результирующей таблицы в отдельный файл:

SELECT … INTO OUTFILE "полное_имя_файла"
FIELDS TERMINATED BY '\t’ (поля разделяются символом табуляции)
LINES TERMINATED BY '\n’ (строки разделяются символом перехода на новую строку)
FROM …;

Для записи всех представляемых на экране данных (и запросов, и результирующей таблицы) в отдельный файл:

TEE полное_имя_файла;

Для отключения данной опции:

NOTEE;